06 Oct Nouvelle étude mondiale sur les variants SAR-COV-2 avec les données du laboratoire de recherche de Baney
Une étude mondiale a été publiée dans la prestigieuse revue « Nature » sur la traçabilité d’une variante spécifique du SARS-CoV-2 qui a été détectée en Afrique centrale – nommée B.1.620 et découverte en Lituanie – grâce aux efforts de séquençage du génome fabriqué sur le continent africain et, plus précisément, du laboratoire de recherche de Baney. Avec cela, 5 articles ont déjà été publiés, sur la base des données fournies par notre jeune laboratoire qui n’est opérationnel que depuis 3 ans.
Après plus d’un an de pandémie et avec une réduction sans précédent de la mobilité humaine dans le monde, différentes lignées de SARS-CoV-2 ont émergé dans plusieurs zones géographiques à travers le monde. Jusqu’à présent, il existe quatre lignées (B.1.1.7, B.1.351, P.1 et B.1.617.2) qui ont été universellement classées comme variantes d’intérêt en raison d’une plus grande transmissibilité, d’une gravité de la maladie et / ou une éventuelle réduction de l’efficacité du vaccin. Dans certains cas, une lignée peut atteindre une fréquence élevée à un endroit et en semer d’autres dans son voisinage, comme la lignée B.1.177 qui s’est répandue en Espagne et s’est ensuite répandue dans le reste de l’Europe.
Le B.1.620 Réunion pour détecter les variants du SARS-COV-2 en Guinée équatoriale
Comme expliqué dans cet article, en utilisant des méthodologies avancées d’inférence géographique à partir d’historiques de voyage enregistrés par des voyageurs infectés, le programme de surveillance génomique pour B.1.620 a été élaboré, qui comprenait des génomes de plusieurs pays européens tels que la France, la Suisse, la Belgique, l’Allemagne, l’Angleterre. , Ecosse, Italie, Espagne, République tchèque, Norvège, Suède, Irlande et Portugal, Amérique du Nord (États-Unis et Canada) et plus récemment les Philippines et la Corée du Sud en Asie.
Mais, fait intéressant, une proportion considérable des cas européens initiaux se sont avérés être des voyageurs revenant du Cameroun. C’est pourquoi, depuis fin avril 2021, les équipes de séquençage opérant en Afrique centrale et travaillant principalement avec des échantillons de République centrafricaine, de Guinée équatoriale, de République démocratique du Congo, du Gabon et dernièrement de la République du Congo, ont été envoyer le génome B.1.620 au GISAID (Global Influenza and Surveillance Response System).
Le Laboratoire de Recherche de Baney, avec le soutien de notre partenaire et laboratoire de référence de l’Institut Suisse de Médecine et d’Hygiène Tropicales, devient un laboratoire de référence pour le séquençage des différentes variantes du virus SARS-COV-2.